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夏の代表的な川魚であり、多くの河川で友釣りなどが楽しまれているアユ。遊漁用の種苗放流や養殖など、内水面漁業において重要な魚種の一つとなっている。養殖業では、人気のある子持ち鮎を効率的に作出するために全雌生産が行われており、その際に遺伝的な性を判別する技術のニーズがある。東京海洋大学の研究グループは、アユ全ゲノム解析と性決定遺伝子を発見。子持ちアユの生産がより正確に行えるようになった。
アユはＸＸ－ＸＹ型の性決定様式を持ち、雄のＹ染色体上に存在する性決定遺伝子によって性が決まると考えられる。また、アユの属するキュウリウオ目は進化の過程でサケマス類の共通祖先と約１億９千万年前に分岐したとされている。
さらに、キュウリウオ目はメダカやマグロなど多くの魚類が属する真骨魚類の共通祖先と約１億８千万年前に分岐したと見解が示されている。したがってアユの全ゲノムを調べることで魚類のゲノム進化の過程を知ることができると考えられる。
研究ではまずアユの全ゲノムを解読し、他の魚類との比較からその特徴を明らかにした。硬骨魚類の祖先の染色体から融合や分裂を経て、現在のアユの染色体にいたる進化の痕跡を探索した。
アユゲノムはおよそ４億５千万塩基対とメダカ（８億塩基対）などと比べると小さく、アユではゲノムの縮小化が起こったことが明らかになった。また天然魚を用いた遺伝解析（ゲノムワイド相関解析）により雄特異的なゲノム領域を明らかにした。
さらに、その領域に存在する候補遺伝子の発現解析などにより候補遺伝子を絞り込むとともに、ゲノム編集（ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ９法）による遺伝子機能解析を実施した。
その結果、Ｙ染色体特異的抗ミュラー管ホルモン型受容体遺伝子がゲノム編集された遺伝的雄個体では、精巣ではなく卵巣が形成され、この遺伝子がアユの性決定遺伝子であることが明らかになった。これにより、アユの遺伝的性判別が正確に実施可能になった。
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